Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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BcanQ61361 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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BcanQ61361 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BcanQ61361 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BcanQ61361 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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BcanQ61361 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
BcanQ61361 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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