Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Klhdc9Q3USL1 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms