Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trafd1Q3UDK1 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trafd1Q3UDK1 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms