Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ctdnep1Q3TP92 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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