Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Sh3bp1P55194 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Sh3bp1P55194 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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