Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NcanP55066 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NcanP55066 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NcanP55066 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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