Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RxraP28700 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RxraP28700 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms