Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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