Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ggta1P23336 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ggta1P23336 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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