Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
H2-M5A7VMS3 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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