Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CtcflA2APF3 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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