Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Hdac5Q9Z2V6 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hdac5Q9Z2V6 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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