Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms