Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc47Q9D024 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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