Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
PtprtQ99M80 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms