Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pcsk9Q80W65 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms