Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Dsg1bQ7TSF1 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms