Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Lrrc43Q3V0L5 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Lrrc43Q3V0L5 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms