Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms