Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Shcbp1lQ3TTP0 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.1 ms