Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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