Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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Rpusd2Q149F1 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rpusd2Q149F1 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
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