Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ttc39dQ0VF76 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ttc39dQ0VF76 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ttc39dQ0VF76 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ttc39dQ0VF76 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ttc39dQ0VF76 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ttc39dQ0VF76 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Ttc39dQ0VF76 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ttc39dQ0VF76 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms