Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ttc21bQ0HA38 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms