Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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NcanP55066 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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NcanP55066 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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NcanP55066 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NcanP55066 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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