Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gli1P47806 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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