Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PdgfraP26618 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms