Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccl20O89093 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms