Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cldn34c3J3QJW5 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms