Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Spocd1B1ASB6 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Spocd1B1ASB6 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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