Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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Col5a3Q9JLI2 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Col5a3Q9JLI2 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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