Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Tmem253Q3UNB8 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Tmem253Q3UNB8 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Tmem253Q3UNB8 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Tmem253Q3UNB8 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Tmem253Q3UNB8 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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Tmem253Q3UNB8 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Tmem253Q3UNB8 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms