Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rpl28P41105 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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