Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
RxrgP28705 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxrgP28705 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms