Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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Hoxd10P28359 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms