Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hoxd9P28357 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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