Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pde6aP27664 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pde6aP27664 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pde6aP27664 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pde6aP27664 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Pde6aP27664 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Pde6aP27664 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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