Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxb2P0C1T1 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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