Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms