Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Prrt4B2RU40 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms