Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Grik3B1AS29 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms