Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccdc89Q9DA73 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccdc89Q9DA73 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc89Q9DA73 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Ccdc89Q9DA73 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Ccdc89Q9DA73 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Ccdc89Q9DA73 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms