Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Trim12aQ99PQ1 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim12aQ99PQ1 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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