Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms