Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
H2-M10.4Q85ZW8 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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