Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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Ccdc18Q640L5 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Ccdc18Q640L5 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
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