Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim71Q1PSW8 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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