Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp46P62069 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms