Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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