Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PrkcaP20444 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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